故事主角科萊麗是個平凡的紐約少女，在酒吧外目睹了一樁神秘謀殺案。除她外的任何人既看不到屍體也看不到行兇者——三個服飾奇特的年輕人。她不知道看見本身就是不可思議——因為凡人本來看不到這些暗影獵人（Shadowhunter）。原來地球存在著一個神秘莫測的地下世界，暗影獵人負責清除為禍人間的地下生物（Downworlder）。三個年輕人是從小一起長大的天然獵人，其中有著天使面孔和痞子作風的男孩是傑斯，另外兩人伊莎貝拉和阿列克是姐弟。【阿列克一直喜歡著傑斯】。由於科萊麗的媽媽稍後離奇失蹤，科萊麗更遭受魔物的追殺，她被迫卷入了傑斯他們的世界。她被告知自己的腦中有一個人為的屏障讓她異於常人，而解開的關鍵在“白骨之城”。四個年輕人踏上旅途，那裏不但有科萊麗的身世謎底，更有地下世界傳說聖物凡人杯（Mortal Cup）的蛛絲馬跡…