在群雄逐鹿，山河日變的“大爭之世”，在英雄輩出，百家爭鳴的戰國時代，華夏大地的西陲正經歷著一場亙古未有的“黑色裂變”。
古老的秦部族正是在這裂變般的陣痛中重生。他們燃燒著自己，用一段段血與淚，愛與恨交織的悲壯故事，推動著整個時代前行。最終大出天下，與中原六國相融合，共同成就華夏文明的正源。
公元前三百六十二年，滿懷壯誌，發誓要奪回老秦故土河西的秦獻公贏師隰，在黃河西岸的少梁山與魏國大軍進行了一場慘烈的廝殺。盡管秦軍斬敵無數，並一舉擒獲對方主帥公孫痤。但秦獻公卻身中毒箭而死。
嫡子嬴渠梁靈前即位，史稱秦孝公。
秦國此時已陷入四面楚歌之絕境，輜重耗盡，兵源匱乏，國力虛弱。秦孝公即位後，秦國危局如獨木撐天，搖搖欲墜。六國在山東召集大會，準備分秦，內外堪憂，秦國的生死存亡，壓在一個22歲的年輕君主身上。
秦孝公贏渠梁清醒地認識到秦國的落後與六國亡秦之心，為了穩定最急於滅秦的魏國，他在所有大臣的反對下，釋放了本應斬首為先父祭靈的魏國丞相公孫痤。並拿出國庫與皇室私庫的所有財產，用秦國不世珍寶，以及巨大商利相誘六國權貴，力保秦國三年無戰事，為秦國贏得了一絲喘息之機。
秦孝公手刻國恥碑，以血塗字，立於宮門，誓以變法強國。秦孝公大召天下賢士，六國學子，入秦為宮。在與賢士的反復切磋度量之中，衛鞅脫穎而出。衛鞅只身一人遊遍秦國窮山惡水，深入荒村野鎮，了解當地民俗民風，努力尋找秦國落後的根源，竭力暝思治秦策略。同時，他也被這樸實，堅毅的秦風深深吸引。在這短短的三個月裏，他便明確了此後二十年，自己與秦國要走的路。
渭水船頭，他一展其為政主張，以他的法家思想折服了秦孝公。衛鞅的《治秦九論》更使其看到了秦國的未來希望。他們連談三天三夜，決定實行變法，以法制國。並立下了“君臣相知，永不相負”的誓言。
秦孝公拜衛鞅為相，開始了君臣二十年的大變法。
衛鞅拜相後，頒布命令，禁止私鬥，平民有戰功可以封爵，取消封地，廢除井田等一系列主張，朝野之間，不啻於天翻地覆。平民封爵，開三皇五帝之先例，廢除封地，動搖封建基礎，更有開阡陌、廢井田，使六國守舊之士頓足大罵，當然，對衛鞅來說，壓力最大的則來自於秦國內部的貴族勢力，嬴渠梁的兄長嬴虔、長史公孫賈、上大夫甘龍等這些前朝權傾朝野的大臣，對衛鞅刻骨仇恨。由於秦孝公的支持，只能在背地下手。
權貴之臣們關註著衛鞅以法治國的成效，到處遊說鼓動，衛鞅通過城門立木，在民間贏得信任。適逢河西村村民群鬥，以身試法，村民們仗著是太子封地，不肯伏法，衛鞅親自監斬，一次斬首七百余眾，天下大嘩。犯人臨死前幡然悔悟的吼聲：“秦人莫忘，私鬥罪死恥辱！公戰流血不朽！”在所有秦人的內心深深地烙下了“法”的烙印。
此事卻震驚了主張 “非戰非攻，除暴政暴君”的政俠墨家的子弟。墨家向來以“除暴天下”為己任，聞知衛鞅的暴行，召集門下弟子，發出除暴令，準備對他們認定的“苛政”，“暴君”，“酷吏”進行大規模的刺殺行動。
秦孝公為了變法不在初期夭折，舍棄一己的生命，親至墨家駐地神農大山，拜見墨子。在墨家論政臺上，孝公慷慨陳詞，連身居幕後的老墨子也被他的英雄氣概與王者風範所折服。老墨子最終決定與秦國冰釋前嫌。秦孝公又要與戀人別離，他們立下了至死不渝的誓言。“天地合，乃敢與君絕。”
變法使得秦國蒸蒸日上。農人力耕，百工勤奮，商市通達，民風日新，人人踴躍參軍，準備殺敵立功，授官封爵。新法法制逐漸深入人心。
為了能夠得到秦王室更堅定的支持，在白雪的理解和勸導下，衛鞅與秦孝公的妹妹——聰敏賢惠的熒玉公主舉行了大婚……
衛鞅的第二批變法令陸續頒布以後，更是朝野沸騰。取消貴族封地，是破天荒的創舉，秦國貴族視他為寇仇一般。河西村的村民給太子交私糧的時候，私糧全部被換為泥沙。太子一怒之下，殺死了幾個村民，又撞在了衛鞅的法令上。這是一次比以往都更艱難的考驗。
衛鞅廢黜了太子，流放他到秦國邊境之地，不得征召，不得回來。太子的兩名師傅公孫賈被放逐隴西牧馬，嬴虔被削去鼻子。
經過這次事變，朝野的風波平息了，衛鞅深知自己的處境，這段仇恨已處在無法化解的地步，即無可解，也不須解。作為法家的大師，他正帶領著秦國一步一步地接近他理想中的大治之世。
秦孝公不顧衛鞅的反對，將商地在名義上封給衛鞅，國人尊稱衛鞅為商君，後世稱商鞅。
整整二十年過去了，變法持續了二十年，秦國的新軍練成，國富民強，百姓勇於公鬥，平民爭立戰功。秦孝公和商鞅都老了，不足五十歲，都已是心力交瘁。秦孝公召回了流放二十年的太子嬴駟，撒手而亡。
嬴駟即位，六國趁機向秦國施加壓力，要求秦國殺商鞅以謝天下。朝堂內外又是一番氣象，陳渣泛起，舊恨新仇都浮上來。一直在秘密破壞變法的老臣們終於可以在陽光下竊竊私語了，他們聽說新國君嬴駟也有殺商鞅的想法，爭先恐後地跳出來。
商鞅將手中的政權、兵權交出，帶領弟子們最後一次修訂秦法，坦然被捕，被五牛分屍。
嬴駟出兵函谷關，進取河西之地，掃清所有反對變法的舊貴族，將商鞅之法立為萬世國法，其實，這是商鞅為保護新君、保護變法而舍其生命下的一步大棋。最後一招，以一己之生命賭秦國萬世之強盛。嬴駟果然英才，後人卻不知道，商鞅才是真正的歷史棋局中的大國手。
而在那充滿霸氣的鹹陽皇宮裏，一個比他任何先輩都要更加冷俊的鐵碗君主，正在謀劃著將怎樣掃平一切膽敢阻擋他完成霸業的朽物。一場新的血雨腥風又將開始了……