許浚的父親平安道龍泉郡首(相當於縣令)，母親是妓女，因為出身卑微、備受歧視，因此雖然他天資聰穎，卻終日放蕩、不求上進。有一天，他在偷襲走私商的過程中認識了多喜，被她事親的孝心感動因而對她關懷備至，在幫助她的過程中目睹了針術的奧妙，之後，多喜的父親去世，深愛多喜的他便一肩承擔起照顧多喜的責任。

有一天，為了醫治母親的急病尋找醫生的過程中遇到了山陰的名醫-柳義泰。經過一番曲折成了柳義泰家中的挑水雜工，開始了他的醫術生涯。但是，嚴重的歧視和柳義泰的冷漠，讓他倍受艱苦。幸而在一個偶然的機會，他認識了客居柳家，的才女睿珍，睿珍欣賞他的學問及人格，開始教導他關於藥草的相關知識。

先祖二十二年，全國爆發傳染病大流行，許浚積極研究病症和藥方，緊接著出現的壬辰倭亂，許浚和母親、妻兒被拆散， 戰爭結束，許浚與妻兒重逢，重整內醫院的醫療設備與醫書。

雖然許浚一直身為光海君的御醫，但他堅持醫生只醫病，不過問政事的清高的態度引來政治迫害，許浚背負逆謀的罪名被判流放到南方。雖然生活顛沛流離，他在那裏獨自著述集傳統韓國醫學大成的「東醫寶鑑」。歷時十餘年，終於編纂完成「東醫寶鑑」。這時，又發生了全國性的瘟疫怪疾，全國上下群醫無策，光海君急召他入宮研究，終於成功研製出抗病處方，然而他自己卻因疲憊過度，不察自己也已染上此病，未來得及施以藥石，便死於妻子懷中...